Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms