Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufm1P61961 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms