Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms