Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vbp1P61759 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms