Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg6P61406 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg6P61406 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg6P61406 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg6P61406 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg6P61406 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg6P61406 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg6P61406 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg6P61406 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg6P61406 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg6P61406 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms