Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl27P61358 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl27P61358 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms