Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme3P61290 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms