Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia3P60469 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms