Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rin3P59729 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rin3P59729 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rin3P59729 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rin3P59729 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rin3P59729 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rin3P59729 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rin3P59729 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms