Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scarf2P59222 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scarf2P59222 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms