Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps33bP59016 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms