Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TdgP56581 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TdgP56581 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TdgP56581 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TdgP56581 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TdgP56581 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TdgP56581 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TdgP56581 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TdgP56581 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TdgP56581 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TdgP56581 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TdgP56581 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TdgP56581 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TdgP56581 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TdgP56581 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TdgP56581 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TdgP56581 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms