Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp5P56399 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp5P56399 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp5P56399 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp5P56399 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms