Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms