Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pex2P55098 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pex2P55098 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms