Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn5P54830 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms