Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rad23aP54726 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms