Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PctpP53808 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PctpP53808 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PctpP53808 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PctpP53808 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PctpP53808 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PctpP53808 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PctpP53808 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PctpP53808 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PctpP53808 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PctpP53808 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PctpP53808 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PctpP53808 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PctpP53808 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PctpP53808 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PctpP53808 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PctpP53808 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PctpP53808 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PctpP53808 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PctpP53808 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PctpP53808 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PctpP53808 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PctpP53808 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PctpP53808 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms