Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lbx1P52955 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Lbx1P52955 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Lbx1P52955 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Lbx1P52955 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Lbx1P52955 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lbx1P52955 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Lbx1P52955 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lbx1P52955 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Lbx1P52955 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Lbx1P52955 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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