Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efnb1P52795 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms