Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox5P52651 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox5P52651 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms