Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms