Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc4P51655 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms