Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TspoP50637 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TspoP50637 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TspoP50637 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TspoP50637 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TspoP50637 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TspoP50637 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TspoP50637 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms