Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb1P50571 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb1P50571 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms