Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Psen1P49769 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psen1P49769 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psen1P49769 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms