Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5P49615 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms