Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HpdP49429 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HpdP49429 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HpdP49429 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HpdP49429 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HpdP49429 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HpdP49429 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HpdP49429 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HpdP49429 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HpdP49429 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HpdP49429 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HpdP49429 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HpdP49429 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HpdP49429 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HpdP49429 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HpdP49429 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HpdP49429 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HpdP49429 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HpdP49429 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HpdP49429 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HpdP49429 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HpdP49429 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HpdP49429 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HpdP49429 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HpdP49429 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HpdP49429 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HpdP49429 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HpdP49429 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HpdP49429 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HpdP49429 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HpdP49429 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HpdP49429 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HpdP49429 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HpdP49429 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HpdP49429 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HpdP49429 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HpdP49429 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HpdP49429 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms