Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptx3P48759 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms