Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms