Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rfx2P48379 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rfx2P48379 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms