Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capza1P47753 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capza1P47753 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms