Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt1P46096 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt1P46096 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt1P46096 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt1P46096 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt1P46096 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt1P46096 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syt1P46096 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syt1P46096 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syt1P46096 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syt1P46096 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syt1P46096 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Syt1P46096 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms