Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc1a2P43006 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc1a2P43006 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms