Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd9P40240 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd9P40240 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd9P40240 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms