Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col18a1P39061 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms