Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk2P38575 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk2P38575 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk2P38575 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms