Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms