Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2aP35436 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Grin2aP35436 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms