Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms