Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoc1P34928 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms