Protein–RNA interactions for Protein: P33174

Kif4, Chromosome-associated kinesin KIF4, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif4P33174 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif4P33174 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif4P33174 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif4P33174 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif4P33174 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif4P33174 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms