Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms