Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GrnP28798 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GrnP28798 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GrnP28798 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GrnP28798 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GrnP28798 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GrnP28798 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GrnP28798 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GrnP28798 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GrnP28798 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GrnP28798 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms