Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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DcnP28654 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DcnP28654 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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DcnP28654 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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DcnP28654 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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DcnP28654 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DcnP28654 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DcnP28654 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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DcnP28654 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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DcnP28654 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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DcnP28654 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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DcnP28654 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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DcnP28654 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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DcnP28654 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DcnP28654 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms