Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd9P28357 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms