Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apex1P28352 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apex1P28352 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms