Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb3P28231 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms