Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms