Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl3P27659 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3P27659 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms